中科院高性能科学计算在生命科学领域应用研讨会在上海召开

由中科院生物局联合计算机网络信息中心主办，上海生命科学研究院承办的 “中科院高性能科学计算在生命科学研究领域应用研讨会”于 5月29日在上海举行。来自北京基因组所、上海药物所、计算生物所、系统生物学中心等上海生科院所属研究所的专家，生物局和院信息办的代表，以及计算机网络信息中心的相关人员等20余人出席了会议，共同探讨高性能科学计算在生命科学研究领域的应用与需求。

会上，计算机网络信息中心超级计算中心主任迟学斌研究员介绍了中科院超级计算环境与支撑服务情况，超级计算中心牛北方介绍了并行计算及其在生物科学研究中的应用。北京基因组所王晶、上海药物所熊兵、上海药物所于坤千、计算生物所徐书华、系统生物学中心王川等分别介绍了高性能计算在基因组学研究、组合数学与几何学研究、比较生物学研究、生物数据挖掘研究，生物大分子构象变化研究，以及复杂生物分子模拟和药物虚拟筛选等方面的研究和应用需求。

与会代表就高性能计算的并行计算能力、软件开发和移植、存储需求、数据远程传输等方面进行了热烈的讨论，并提出了很多宝贵的建议。专家们认为，生命科学研究对高性能计算机的需求日益增加。现有研究所的计算机资源已经不能满足日益增长的大规模数据和大计算量的需求、迫切需要引进更大处理能力的高性能计算机。生命科学领域一直是高性能计算的重要应用领域，其中很多科学研究工作依赖于高性能计算机。由于现在国内的计算资源与国际同行的差距日益加大，导致国内的科学家的计算规模无法加大、应用水平难以提高，在应用科学研究中越来越被动，研究及成果与国际先进行列的差距不断加大。如果不能及时引进新的高性能计算机系统，我国在基因组、生物制药等生命科学领域的研究与应用将在国际上失去目前的先进地位，无法实现自主创新的科研目标。

专家们认为，作为科学院信息化服务和支撑机构的网络中心应该配备百万亿次的高性能计算机，支撑研究所科学研究对高性能计算机的需求。网络中心应进一步加强与各研究所沟通，深入到学科领域，针对生命科学领域的高性能计算应用特点，改善高性能计算环境，推动生命科学在网络中心超级计算中心应用的逐步深入。会议最后达成一致意见，研究所将各自计算量的需求统计整理，为院有关领导和相关部门科学决策提供依据，以保证高性能计算资源更加科学合理地用，进而推动我院科研信息化的发展。